Obiectivul principal al proiectului ALERTERS este de a identifica indicatori alternativi, microbieni și de rezistență la antibiotice, care permit evaluarea corectă a stării ecosistemelor lotice și posibilele surse de contaminare.
Aplicabilitatea metodelor propuse va fi: i) verificată prin compararea abundenței indicatorilor alternativi cu cea a patogenilor și a indicatorilor clasici de contaminare fecală, și ii) validată prin cuantificarea indicatorilor selectați din probe reprezentative. Totodată, detectabilitatea și persistența acestor indicatori alternativi va fi evaluată în laborator prin experimente de tip microcosm.